Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SypQ62277 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SypQ62277 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SypQ62277 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SypQ62277 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SypQ62277 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SypQ62277 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SypQ62277 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SypQ62277 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SypQ62277 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SypQ62277 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SypQ62277 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SypQ62277 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SypQ62277 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SypQ62277 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SypQ62277 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SypQ62277 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SypQ62277 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SypQ62277 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SypQ62277 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SypQ62277 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SypQ62277 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SypQ62277 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms