Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpaQ62189 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpaQ62189 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpaQ62189 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms