Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4aQ62178 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sema4aQ62178 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4aQ62178 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4aQ62178 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4aQ62178 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4aQ62178 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sema4aQ62178 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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