Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkciQ62074 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkciQ62074 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkciQ62074 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms