Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phox2aQ62066 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phox2aQ62066 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phox2aQ62066 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms