Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mrc1Q61830 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrc1Q61830 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mrc1Q61830 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mrc1Q61830 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms