Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms