Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3Q61817 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3Q61817 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms