Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LbpQ61805 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbpQ61805 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LbpQ61805 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LbpQ61805 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LbpQ61805 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LbpQ61805 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LbpQ61805 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms