Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f1Q61501 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E2f1Q61501 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f1Q61501 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2f1Q61501 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms