Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pde3bQ61409 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde3bQ61409 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde3bQ61409 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms