Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gata6Q61169 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gata6Q61169 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gata6Q61169 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata6Q61169 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms