Protein–RNA interactions for Protein: Q61092

Lamc2, Laminin subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc2Q61092 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc2Q61092 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamc2Q61092 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc2Q61092 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc2Q61092 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms