Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna1Q60960 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kpna1Q60960 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kpna1Q60960 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms