Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbc1d1Q60949 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d1Q60949 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d1Q60949 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms