Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a4Q60857 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a4Q60857 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms