Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp1r1bQ60829 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r1bQ60829 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r1bQ60829 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r1bQ60829 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r1bQ60829 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms