Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atf3Q60765 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atf3Q60765 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf3Q60765 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf3Q60765 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms