Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samhd1Q60710 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samhd1Q60710 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samhd1Q60710 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samhd1Q60710 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms