Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Xrcc1Q60596 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xrcc1Q60596 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc1Q60596 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms