Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema5bQ60519 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema5bQ60519 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema5bQ60519 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms