Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A1cfQ5YD48 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A1cfQ5YD48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A1cfQ5YD48 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A1cfQ5YD48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms