Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp20Q5XG71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp20Q5XG71 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp20Q5XG71 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms