Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf15Q5UBV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf15Q5UBV8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms