Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thoc6Q5U4D9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thoc6Q5U4D9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Thoc6Q5U4D9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms