Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdcp1Q5U462 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdcp1Q5U462 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdcp1Q5U462 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms