Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim38Q5SZ99 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim38Q5SZ99 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim38Q5SZ99 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms