Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brip1Q5SXJ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brip1Q5SXJ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brip1Q5SXJ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms