Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NacadQ5SWP3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NacadQ5SWP3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
NacadQ5SWP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
NacadQ5SWP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NacadQ5SWP3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NacadQ5SWP3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms