Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsr1Q5SWD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsr1Q5SWD9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsr1Q5SWD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms