Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp18Q5SSI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp18Q5SSI6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Utp18Q5SSI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Utp18Q5SSI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms