Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh12Q5RJH3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh12Q5RJH3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh12Q5RJH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms