Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlha9Q5RJB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlha9Q5RJB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms