Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11487Q5RIS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gm11487Q5RIS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm11487Q5RIS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms