Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col27a1Q5QNQ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col27a1Q5QNQ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col27a1Q5QNQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col27a1Q5QNQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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