Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q5EBG8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q5EBG8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5EBG8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5EBG8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5EBG8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q5EBG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Q5EBG8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q5EBG8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q5EBG8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q5EBG8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q5EBG8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms