Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eme2Q56A04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eme2Q56A04 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eme2Q56A04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms