Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc47Q505F5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc47Q505F5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc47Q505F5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms