Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1qtnf9Q4ZJN1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms