Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox3aQ4TU90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rhox3aQ4TU90 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms