Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx49Q4FZF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx49Q4FZF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx49Q4FZF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx49Q4FZF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms