Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1T4

P3h1, Prolyl 3-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3h1Q3V1T4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P3h1Q3V1T4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P3h1Q3V1T4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3h1Q3V1T4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3h1Q3V1T4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms