Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd5Q3V1H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd5Q3V1H9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms