Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ulk4Q3V129 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ulk4Q3V129 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk4Q3V129 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ulk4Q3V129 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms