Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc185Q3V118 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc185Q3V118 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc185Q3V118 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms