Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UY34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UY34 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UY34 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UY34 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UY34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UY34 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3UY34 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UY34 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UY34 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3UY34 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UY34 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UY34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UY34 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UY34 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UY34 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UY34 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UY34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UY34 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UY34 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UY34 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UY34 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UY34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3UY34 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3UY34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3UY34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3UY34 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms