Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn4Q3UV66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn4Q3UV66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn4Q3UV66 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms