Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nr1d1Q3UV55 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr1d1Q3UV55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1d1Q3UV55 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms