Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prom2Q3UUY6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prom2Q3UUY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prom2Q3UUY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Prom2Q3UUY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms