Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cracr2aQ3UP38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cracr2aQ3UP38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms