Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp30Q3UN04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp30Q3UN04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms